Windows版で作成したNoteCaseの文書をPuppyで開くと
警告：
この文書は異なったアプリケーション、
(NoteCaseとNoteCase Proは異なったアプリケーションです)
又は本プログラムの新バージョンで作成されています
この文書を編集すると、フォーマットの一部が失われることがあります！
などと表示される。よく考えるとWindows側は最新バージョンだった事に気づく、しかし無視して「OK」を押すと何の問題も無く文書が開ける。よくある文字バケなどは起こらない。逆にPuppyで作成した物をWindowsで開いても問題無く表示できる。エンコードや、フォントの設定も自動で行っているのかどうかは知らないが、すごく便利だ。おかしな所は、左に表示されるノードタブの高さが多少違う、これはバージョン違いによるものかどうかは分からない。本当に使える素晴らしいソフトの一つだ。